La UNAM cuenta con el primer microarreglo en México hecho a la medida. Se trata de un dispositivo en el que están inmovilizadas 38 mil sondas especie determinadas para detectar 280 patógenos, entre ellos bacterias, hongos, virus, microalgas, dinoflagelados (productores de toxinas) y genes asociados a la resistencia a antibióticos en bacterias Gram-negativas y Gram-positivas.
El sistema (construido por la empresa AFFYMETRIX) utiliza ácido desoxirribonucleico (ADN) que se obtiene de muestras del ambiente como agua, aire, suelo, alimentos o superficies inertes.
El Laboratorio de Estudios Ecogenómicos de la Unidad de Biología de Conservación de la Unidad Académica de Ciencias y Tecnología de la UNAM en Yucatán diseñó este dispositivo basado en tecnología de ADN para la detección oportuna de agentes que pueden causar enfermedades diarreicas, respiratorias, infecciones nosocomiales e intoxicaciones por consumo de productos del mar contaminados durante los eventos de florecimientos algales nocivos en la zona costera de Yucatán; sin embargo, este dispositivo puede ser usado en cualquier parte del país.
Identificación en el ADN
Basados en el principio de que el ADN es una molécula universal presente en todos los seres vivos, con las tecnologías actuales es posible identificar un organismo a partir de un segmento de dicha molécula.
Entre otras, la técnica de microarreglos es ampliamente utilizada en el mundo por su sensibilidad y por la importante cantidad de información que puede ser analizada en cada microchip (hasta seis millones de sondas en un centímetro cuadrado).
El microchip está formado por un conjunto de sondas de genes que se encuentran inmovilizados sobre una pequeña superficie. Si en el ADN que se vierte en esta superficie existe ADN complementario a alguna de las sondas inmovilizadas, éstas se unirán por su afinidad específica. Dado que las moléculas están marcadas, emiten luz al ser excitadas por el equipo lector, dando como resultado una imagen con puntos luminosos donde hubo hibridación de ADN y donde se detecta la presencia de los genes en estudio.
Algoritmo computacional
Con un algoritmo computacional, esa imagen de puntos luminosos, es decir, la información de la ubicación de los patógenos en el arreglo, permite generar una tabla con los patógenos detectados.
Los micoarreglos se utilizan para obtener patrones de expresión de genes o de sus funciones que se observan como mapas que reflejan el orden y la lógica del programa genético en el caso de alguna enfermedad, y también se utilizan ampliamente en genotipificación: identificación de genes especie específicos, como en el caso del microarreglo universitario.
En el mercado internacional existen microarreglos diseñados para diversos temas, en particular para problemas de salud, sobre todo en el campo del cáncer y enfermedades metabólicas; sin embargo, no existía una alternativa con perfil nacional que atendiera a los agentes que coexisten en México, por lo que este microarreglo representa una opción novedosa para detectar de manera oportuna riesgos a la salud, generando información relevante en torno a la protección y manejo ambiental.
Ahora que ya se cuenta con el microarreglo se analizarán muestras ambientales de la zona costera, reservas naturales, lugares recreativos, plantas de tratamiento de aguas y ambientes hospitalarios.
El proyecto ha sido financiado por el Conacyt, a través de la convocatoria Problemas Nacionales 2013.
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